Egenskaper genotyp, reaktionsstandard, bestämning

han genotyp Det definieras som uppsättningen av gener (med sina alleler) som de kodar för en viss funktion eller en egenskap, som skiljer sig från andra av en specifik funktion eller sekvens. Vissa författare definierar emellertid också det som den del av genomet som ger upphov till fenotypen eller som en organismens alleliska konstitution.

Även om de är relaterade är termerna genotyp och fenotyp inte samma sak. I detta avseende definieras fenotyp som uppsättningen av synliga egenskaper hos en organisme som är resultatet av uttrycket av dess gener och till genotypen som uppsättningen av gener som resulterar i en viss fenotyp.

Genotyp och fenotyp (källa: National Human Genome Research Institute [Public Domain] via Wikimedia Commons) Genotypen är bara en av de faktorer som är involverade i upprättandet av fenotypen, eftersom miljöns inflytande och andra epigenetiska element som inte är direkt relaterade Till nukleotidsekvensen formar också de synliga egenskaperna hos individer.

Således har två organismer samma genotyp om de delar samma genuppsättningar, men detsamma gäller inte för två organismer som tydligen delar samma fenotyp, eftersom liknande egenskaper kan vara produkten från olika gener.

Det var den danska botanisten Wilhelm Johansen, 1909, som först introducerade i vetenskapen som är genotyp och fenotyp, i en lärobok som han titlade "Elementen i en teori om exakt arv ", som var produkten av en serie experiment som utförde korsade rena korn och ärtor.

Hans verk, förmodligen inspirerade av de som gjordes några år tidigare av Gregorio Mendel, betraktas som "Genetik far”, Tillät honom att klargöra att genotypen för en organisme ger upphov till fenotypen genom olika utvecklingsprocesser och under påverkan av miljön.

[TOC]

Egenskaper

Genotyp är inte exakt samma som genom. Här är skillnaden mellan båda begreppen:

- "Genome" hänvisar till alla gener som en individ har ärvt från sina föräldrar och hur de distribueras i kromosomerna i kärnan.

- "Genotyp" är termen som används för att till exempel hänvisa till uppsättningen av gener och deras varianter som ger upphov till en viss funktion, att en individ skiljer sig inom en befolkning eller en art.

Även om det är benäget att förändringar på grund av mutationer under hela organismens vitala historia, är genotypen ett relativt oundvikligt drag hos individer, eftersom i teorin är generna som ärftas desamma från befruktningen till döden.

I en naturlig population har allelerna som utgör en given genotyp olika frekvenser av utseende; Det vill säga vissa förekommer i populationer mer än andra och detta hänför sig, mellan vissa saker, med distribution, miljöförhållanden, närvaron av andra arter etc.

Termen "genotyp vild”Definierar den första alleliska varianten som finns i naturen, men hänvisar inte nödvändigtvis till allelen som finns oftare inom en befolkning; och termen "genotyp Mutant”Det används för närvarande för att definiera de alleler som skiljer sig från naturen.

För att skriva en genotyp används stora bokstäver och små bokstäver vanligtvis för att skilja mellan allelerna som en individ har, vare sig homozygotiska eller heterozygota. Kapitalbokstäver används för att definiera dominerande och små bokstäver för recessives.

Genotypreaktionsregel

Individer ärver sina förälders gener, men inte de slutliga produkterna som erhålls från deras uttryck, eftersom de är beroende av många externa faktorer och deras utvecklingshistoria.

Enligt detta och endast hänvisar till miljöfaktorer kan en genotyp leda till mer än en fenotyp. Uppsättningen av möjliga "resultat" av interaktionen mellan en specifik genotyp med olika miljöer är vad forskare har kallat "genotypreaktionsregel".

Reaktionsnormen för en genotyp är då en typ av "kvantifiering" eller registrering av de synliga egenskaperna erhållna från interaktioner mellan en genotyp med vissa miljöer. Det kan uttryckas som grafik eller tabeller som "förutsäger" de möjliga resultaten.

Det är naturligtvis uppenbart att reaktionsstandarden endast hänvisar till en partiell genotyp, en partiell fenotyp och några få miljöfaktorer, eftersom det i praktiken är mycket svårt att förutsäga absolut alla interaktioner och alla resultat av dessa.

Hur bestäms genotyp?

Bestäm genotypen eller "genotipify" en organisme eller en population av individer av samma art, ger mycket värdefull information om dess evolutionära biologi, dess befolkningsbiologi, dess taxonomi, dess ekologi och dess genetiska mångfald.

I mikroorganismer som bakterier och jästar, eftersom de har högre multiplikation och mutationshastigheter än de flesta multicellulära organismer, bestämmer och känner till att genotypen kan kontrollera koloniernas identitet i samlingarna, samt fastställa vissa egenskaper hos epidemiologi, ekologi och taxonomi av samma.

För att bestämma genotypen är det nödvändigt att få prover av den organisme som du vill arbeta med, och de nödvändiga typerna av prover beror på varje organisme. Hos djur kan till exempel prover av olika vävnader tas: svans, öron, avföring, hår eller blod.

Genotypen för en organisme kan bestämmas experimentellt tack vare användningen av vissa moderna tekniker, som kommer att bero på den genomiska platsen för generna för att studera, budgeten och tiden, användarvänligheten och graden av prestanda som önskas önskad.

För närvarande inkluderar de tekniker som används för genotipifiering av en organisme, ofta användning och analys av molekylmarkörer för att upptäcka polymorfismer i DNA och andra mer avancerade tekniker som innebär genomsekvensering.

Fler anställdsmarkörer

Bland de mest använda markörerna hittar vi följande:

- RFLP: er (polymorfismer av begränsningsfragment).

- AFLP: er (förstärkta fragment längd polymorfismer).

- RAPD: er (slumpmässigt förstärkt polymorf DNA).

- Microsatellites eller SSRS (upprepad enkel sekvens).

- ASAPS (primrar associerade med specifika alleler).

- SNP: er (enkla nukleotidpolymorfismer).

Tekniker som använder sekvensering och hybridisering

Och bland de tekniker som använder specifik sekvensering och hybridisering av specifika sonder är:

- Sekvensering med Sangers metod.

- Högpresterande genotipificering.

- Repetition "Golden Gate”Från Illumina.

- Sekvenseringsgenotipifiering (GBS).

- Taqman -uppsats.

- Ny generationens sekvensering.

- Mikrotärare.

- Full genomsekvensering.

Referenser

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, D., & Miller, J. (2005). En introduktion till genetisk analys (8: e upplagan.). Freeman, W. H. Och företag.
2. Klug, w., Cummings, m., & Spencer, c. (2006). Genetikbegrepp (8: e upplagan.). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, s.-OCH. (2001). Metoder för genotypning av enstaka nukleotidpolymorfismer. Annu. Varv. Genomik hum. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, M. (1997). Vad exakt är genom, genotyper och fenotyper? Och hur är det med fenomen ? J. Teor. Biogus., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, L. L. (1999). AFLP -genotypning och fingeravtryck. Träd, 14(10), 389-394.
6. National Institute of Health. Hämtad 14 maj 2019 från www.Nih.Gov/
7. Patel, D. TILL., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Framsteg inom växtgenotypning: där framtiden tar oss. I j. Batley (ed.), Växtgenotypning: Metoder och protokoll (Vol. 1245, sid. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, b. (2012). Genetik: En konceptuell strategi. Freeman, W. H. Och företag.
9. Schleif, r. (1993). Biologisk genetik och molekylär (2: a upplagan.). Maryland: Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, f. (2014). Genotypningsmetoder. I en. Filloux & J. L. Ramos (eds.), Metoder i molekylärbiologi (Vol. 1149, sid. 33-47). New York.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, Q., Lin och., & Fang, m. (2013). Granskning av utvecklingen av genotypningsmetoder för att bedöma mångfalden av jordbruksdjur. Journal of Animal Science and Biotechnology, 4(2), 2-6.